Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CtcflA2APF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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