Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlfA2A7F4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms