Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms