Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms