Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms