Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms