Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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