Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn8Q9Z260 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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