Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sh3bp5Q9Z131 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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Sh3bp5Q9Z131 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Sh3bp5Q9Z131 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Sh3bp5Q9Z131 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5Q9Z131 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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