Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4b1Q9WV76 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms