Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms