Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms