Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Col4a4Q9QZR9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms