Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc1Q9QZF2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms