Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms