Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms