Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr5Q9JLF7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms