Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FancaQ9JL70 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms