Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms