Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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