Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc12a4Q9JIS8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms