Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms