Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms