Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms