Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fundc1Q9DB70 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms