Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pop5Q9DB28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms