Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tmem239Q9DA47 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Tmem239Q9DA47 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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