Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9DA42 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DA42 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DA42 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DA42 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms