Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms