Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms