Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifrd2Q9D8U0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms