Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tspan13Q9D8C2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tspan13Q9D8C2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms