Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cldn22Q9D7U6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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