Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms