Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v1e2Q9D593 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms