Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Zc2hc1bQ9D534 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms