Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms