Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf2lQ9D478 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms