Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933428M09RikQ9D3X3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms