Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy3Q9D394 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms