Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms