Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp11Q9CZJ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms