Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc77Q9CZH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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