Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms