Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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