Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms