Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm5Q9CXE0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm5Q9CXE0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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