Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Wdr55Q9CX97 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Wdr55Q9CX97 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Wdr55Q9CX97 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Wdr55Q9CX97 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr55Q9CX97 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Wdr55Q9CX97 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr55Q9CX97 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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