Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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