Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms